Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SynrgQ5SV85 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SynrgQ5SV85 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SynrgQ5SV85 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SynrgQ5SV85 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms