Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc42Q5SV66 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc42Q5SV66 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc42Q5SV66 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms