Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sco1Q5SUC9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sco1Q5SUC9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sco1Q5SUC9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms