Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm11487Q5RIS0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm11487Q5RIS0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm11487Q5RIS0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm11487Q5RIS0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm11487Q5RIS0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm11487Q5RIS0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm11487Q5RIS0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm11487Q5RIS0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm11487Q5RIS0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms