Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Trim41Q5NCC3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Trim41Q5NCC3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Trim41Q5NCC3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Trim41Q5NCC3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Trim41Q5NCC3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Trim41Q5NCC3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Trim41Q5NCC3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Trim41Q5NCC3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Trim41Q5NCC3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Trim41Q5NCC3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Trim41Q5NCC3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Trim41Q5NCC3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Trim41Q5NCC3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Trim41Q5NCC3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Trim41Q5NCC3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Trim41Q5NCC3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Trim41Q5NCC3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Trim41Q5NCC3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Trim41Q5NCC3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Trim41Q5NCC3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Trim41Q5NCC3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Trim41Q5NCC3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Trim41Q5NCC3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Trim41Q5NCC3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Trim41Q5NCC3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Trim41Q5NCC3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Trim41Q5NCC3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
Trim41Q5NCC3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Trim41Q5NCC3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Trim41Q5NCC3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms