Protein–RNA interactions for Protein: Q5ISE2

Zfp36l3, mRNA decay activator protein ZFP36L3, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36l3Q5ISE2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp36l3Q5ISE2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp36l3Q5ISE2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp36l3Q5ISE2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp36l3Q5ISE2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp36l3Q5ISE2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp36l3Q5ISE2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp36l3Q5ISE2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp36l3Q5ISE2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp36l3Q5ISE2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp36l3Q5ISE2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp36l3Q5ISE2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp36l3Q5ISE2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp36l3Q5ISE2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp36l3Q5ISE2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms