Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpm3Q5F4S9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpm3Q5F4S9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpm3Q5F4S9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpm3Q5F4S9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpm3Q5F4S9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpm3Q5F4S9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpm3Q5F4S9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpm3Q5F4S9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpm3Q5F4S9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpm3Q5F4S9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpm3Q5F4S9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpm3Q5F4S9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpm3Q5F4S9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpm3Q5F4S9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpm3Q5F4S9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpm3Q5F4S9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpm3Q5F4S9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpm3Q5F4S9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpm3Q5F4S9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpm3Q5F4S9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpm3Q5F4S9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpm3Q5F4S9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpm3Q5F4S9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpm3Q5F4S9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Trpm3Q5F4S9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trpm3Q5F4S9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms