Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prune2Q52KR3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Prune2Q52KR3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms