Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spire1Q52KF3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spire1Q52KF3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spire1Q52KF3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms