Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccnl1Q52KE7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccnl1Q52KE7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccnl1Q52KE7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccnl1Q52KE7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms