Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5935Q497S0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5935Q497S0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5935Q497S0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms