Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV9

Ncbp1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp1Q3UYV9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ncbp1Q3UYV9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncbp1Q3UYV9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncbp1Q3UYV9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ncbp1Q3UYV9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 255.2 ms