Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm29609Q3UU56 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm29609Q3UU56 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm29609Q3UU56 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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