Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chpf2Q3UU43 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Chpf2Q3UU43 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chpf2Q3UU43 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms