Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ell2Q3UKU1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ell2Q3UKU1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ell2Q3UKU1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ell2Q3UKU1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ell2Q3UKU1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ell2Q3UKU1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ell2Q3UKU1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ell2Q3UKU1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ell2Q3UKU1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ell2Q3UKU1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ell2Q3UKU1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ell2Q3UKU1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ell2Q3UKU1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ell2Q3UKU1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ell2Q3UKU1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ell2Q3UKU1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ell2Q3UKU1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ell2Q3UKU1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ell2Q3UKU1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ell2Q3UKU1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ell2Q3UKU1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ell2Q3UKU1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ell2Q3UKU1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ell2Q3UKU1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms