Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Usp19Q3UJD6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp19Q3UJD6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp19Q3UJD6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp19Q3UJD6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp19Q3UJD6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp19Q3UJD6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp19Q3UJD6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp19Q3UJD6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp19Q3UJD6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp19Q3UJD6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp19Q3UJD6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp19Q3UJD6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp19Q3UJD6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp19Q3UJD6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp19Q3UJD6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp19Q3UJD6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp19Q3UJD6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp19Q3UJD6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp19Q3UJD6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp19Q3UJD6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp19Q3UJD6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp19Q3UJD6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp19Q3UJD6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp19Q3UJD6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp19Q3UJD6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.56■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Usp19Q3UJD6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms