Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sf3b2Q3UJB0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sf3b2Q3UJB0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sf3b2Q3UJB0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Sf3b2Q3UJB0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Sf3b2Q3UJB0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Sf3b2Q3UJB0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Sf3b2Q3UJB0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sf3b2Q3UJB0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sf3b2Q3UJB0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sf3b2Q3UJB0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sf3b2Q3UJB0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sf3b2Q3UJB0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sf3b2Q3UJB0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sf3b2Q3UJB0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sf3b2Q3UJB0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sf3b2Q3UJB0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sf3b2Q3UJB0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sf3b2Q3UJB0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sf3b2Q3UJB0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sf3b2Q3UJB0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Sf3b2Q3UJB0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sf3b2Q3UJB0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Sf3b2Q3UJB0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sf3b2Q3UJB0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sf3b2Q3UJB0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms