Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc34Q3UI66 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc34Q3UI66 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc34Q3UI66 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms