Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tbc1d2bQ3U0J8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tbc1d2bQ3U0J8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 665.3 ms