Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0I6

Smim6, MCG148180, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim6Q3U0I6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim6Q3U0I6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim6Q3U0I6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms