Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD49

Sppl2b, Signal peptide peptidase-like 2B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2bQ3TD49 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sppl2bQ3TD49 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sppl2bQ3TD49 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sppl2bQ3TD49 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 355.3 ms