Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc69Q3TCJ8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc69Q3TCJ8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc69Q3TCJ8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc69Q3TCJ8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc69Q3TCJ8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc69Q3TCJ8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc69Q3TCJ8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc69Q3TCJ8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc69Q3TCJ8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc69Q3TCJ8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc69Q3TCJ8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc69Q3TCJ8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc69Q3TCJ8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc69Q3TCJ8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc69Q3TCJ8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc69Q3TCJ8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc69Q3TCJ8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc69Q3TCJ8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc69Q3TCJ8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc69Q3TCJ8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc69Q3TCJ8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc69Q3TCJ8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc69Q3TCJ8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc69Q3TCJ8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.4 ms