Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prr27Q3SYJ2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prr27Q3SYJ2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms