Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp2b3Q0VF55 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp2b3Q0VF55 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp2b3Q0VF55 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms