Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisal1Q0VBP7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisal1Q0VBP7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms