Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tff1Q08423 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff1Q08423 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff1Q08423 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms