Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AmbpQ07456 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AmbpQ07456 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AmbpQ07456 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AmbpQ07456 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AmbpQ07456 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
AmbpQ07456 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AmbpQ07456 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AmbpQ07456 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AmbpQ07456 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AmbpQ07456 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AmbpQ07456 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AmbpQ07456 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AmbpQ07456 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AmbpQ07456 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AmbpQ07456 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmbpQ07456 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmbpQ07456 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmbpQ07456 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmbpQ07456 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmbpQ07456 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmbpQ07456 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AmbpQ07456 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AmbpQ07456 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AmbpQ07456 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AmbpQ07456 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AmbpQ07456 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AmbpQ07456 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms