Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gdf3Q07104 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gdf3Q07104 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gdf3Q07104 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms