Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Siah1bQ06985 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Siah1bQ06985 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Siah1bQ06985 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms