Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hspg2Q05793 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hspg2Q05793 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms