Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox9Q04887 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox9Q04887 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sox9Q04887 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms