Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cacna1sQ02789 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.54■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cacna1sQ02789 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cacna1sQ02789 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cacna1sQ02789 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Cacna1sQ02789 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cacna1sQ02789 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Cacna1sQ02789 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cacna1sQ02789 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cacna1sQ02789 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cacna1sQ02789 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cacna1sQ02789 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms