Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VcpQ01853 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VcpQ01853 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VcpQ01853 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VcpQ01853 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VcpQ01853 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VcpQ01853 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VcpQ01853 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VcpQ01853 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VcpQ01853 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VcpQ01853 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VcpQ01853 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VcpQ01853 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VcpQ01853 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VcpQ01853 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms