Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HmmrQ00547 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HmmrQ00547 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms