Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lig3P97386 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lig3P97386 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lig3P97386 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lig3P97386 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lig3P97386 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lig3P97386 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lig3P97386 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lig3P97386 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lig3P97386 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lig3P97386 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lig3P97386 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lig3P97386 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lig3P97386 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lig3P97386 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms