Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rps3aP97351 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps3aP97351 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms