Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Vgll3P85442 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vgll3P85442 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vgll3P85442 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vgll3P85442 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vgll3P85442 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vgll3P85442 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vgll3P85442 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vgll3P85442 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vgll3P85442 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vgll3P85442 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vgll3P85442 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vgll3P85442 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vgll3P85442 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vgll3P85442 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vgll3P85442 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vgll3P85442 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vgll3P85442 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vgll3P85442 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vgll3P85442 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Vgll3P85442 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vgll3P85442 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vgll3P85442 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vgll3P85442 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vgll3P85442 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vgll3P85442 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vgll3P85442 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vgll3P85442 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vgll3P85442 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vgll3P85442 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vgll3P85442 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vgll3P85442 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vgll3P85442 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vgll3P85442 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vgll3P85442 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vgll3P85442 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vgll3P85442 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vgll3P85442 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vgll3P85442 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vgll3P85442 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vgll3P85442 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vgll3P85442 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vgll3P85442 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vgll3P85442 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Vgll3P85442 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vgll3P85442 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vgll3P85442 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vgll3P85442 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vgll3P85442 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vgll3P85442 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vgll3P85442 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vgll3P85442 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms