Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Irx2P81066 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx2P81066 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx2P81066 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx2P81066 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Irx2P81066 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Irx2P81066 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx2P81066 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx2P81066 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx2P81066 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx2P81066 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx2P81066 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx2P81066 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx2P81066 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms