Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Polr1bP70700 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Polr1bP70700 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Polr1bP70700 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Polr1bP70700 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Polr1bP70700 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Polr1bP70700 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Polr1bP70700 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Polr1bP70700 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr1bP70700 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr1bP70700 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr1bP70700 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr1bP70700 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr1bP70700 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Polr1bP70700 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Polr1bP70700 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Polr1bP70700 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Polr1bP70700 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Polr1bP70700 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Polr1bP70700 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Polr1bP70700 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Polr1bP70700 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Polr1bP70700 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Polr1bP70700 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms