Protein–RNA interactions for Protein: P70424

Erbb2, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb2P70424 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Erbb2P70424 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Erbb2P70424 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Erbb2P70424 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Erbb2P70424 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Erbb2P70424 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Erbb2P70424 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Erbb2P70424 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Erbb2P70424 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Erbb2P70424 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Erbb2P70424 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Erbb2P70424 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Erbb2P70424 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Erbb2P70424 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Erbb2P70424 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Erbb2P70424 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Erbb2P70424 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Erbb2P70424 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Erbb2P70424 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Erbb2P70424 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Erbb2P70424 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Erbb2P70424 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Erbb2P70424 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Erbb2P70424 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Erbb2P70424 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Erbb2P70424 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Erbb2P70424 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Erbb2P70424 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Erbb2P70424 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Erbb2P70424 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Erbb2P70424 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Erbb2P70424 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Erbb2P70424 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Erbb2P70424 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Erbb2P70424 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Erbb2P70424 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Erbb2P70424 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Erbb2P70424 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Erbb2P70424 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Erbb2P70424 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Erbb2P70424 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Erbb2P70424 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Erbb2P70424 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Erbb2P70424 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Erbb2P70424 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Erbb2P70424 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Erbb2P70424 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Erbb2P70424 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Erbb2P70424 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Erbb2P70424 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Erbb2P70424 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Erbb2P70424 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191.6 ms