Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrkcbP68404 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkcbP68404 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PrkcbP68404 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms