Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps3P62908 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rps3P62908 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rps3P62908 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps3P62908 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps3P62908 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps3P62908 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rps3P62908 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rps3P62908 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rps3P62908 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rps3P62908 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps3P62908 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps3P62908 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps3P62908 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps3P62908 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.8 ms