Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpeP62305 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpeP62305 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SnrpeP62305 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.2 ms