Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrch1P62046 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrch1P62046 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrch1P62046 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms