Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx1bP61264 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Stx1bP61264 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx1bP61264 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx1bP61264 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx1bP61264 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx1bP61264 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx1bP61264 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Stx1bP61264 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx1bP61264 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx1bP61264 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx1bP61264 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx1bP61264 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx1bP61264 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx1bP61264 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx1bP61264 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Stx1bP61264 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx1bP61264 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx1bP61264 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx1bP61264 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Stx1bP61264 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms