Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CirbpP60824 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CirbpP60824 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CirbpP60824 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CirbpP60824 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CirbpP60824 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CirbpP60824 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CirbpP60824 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CirbpP60824 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CirbpP60824 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CirbpP60824 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CirbpP60824 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CirbpP60824 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CirbpP60824 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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