Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hps5P59438 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hps5P59438 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hps5P59438 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hps5P59438 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hps5P59438 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hps5P59438 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hps5P59438 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hps5P59438 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hps5P59438 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps5P59438 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps5P59438 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hps5P59438 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps5P59438 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps5P59438 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms