Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NcstnP57716 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NcstnP57716 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NcstnP57716 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NcstnP57716 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NcstnP57716 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NcstnP57716 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NcstnP57716 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NcstnP57716 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms