Protein–RNA interactions for Protein: P56960

Exosc10, Exosome component 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc10P56960 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Exosc10P56960 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Exosc10P56960 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms