Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irf5P56477 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irf5P56477 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irf5P56477 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irf5P56477 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irf5P56477 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Irf5P56477 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irf5P56477 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms